Obiectivul de conservare a acestei rezervații îl reprezintă specia Paeonia peregrina var. romanica, specie vulnerabilă şi rară, cunoscută în popor și sub denumirea de bujor de stepă.
Pe lângă această specie de bujor românesc, în Pădurea Troianu, se mai întâlnesc şi alte elemente de floră sălbatică înscrise pe Lista Roşie a Plantelor Superioare din România (Salvia aethiopis, Melica ciliata, Polycnemum verrucosum, Dianthus pallens) pentru care a fost necesară luarea unor măsuri de conservare în