Registrul Zonelor Protejate reprezintă partea integrantă a procesului de implementare a Directivei Cadru Apă şi are un caracter dinamic datorită calendarelor specifice legislaţiei care stau la baza categoriilor de zone protejate cuprinse în acest document. Un aspect important în procesul de actualizare a acestor documente îl reprezintă colaborarea Administraţiilor Bazinale de Apă cu institute de cercetare, agenţii de protecţia mediului, operatori ai serviciilor de apă, autorităţi locale